面對全球疫情嚴峻，各國疫苗大廠都竭力加速研發與製程速度，期許即早將新冠肺炎帶來的衝擊降至最低。西門子與BioNTech生物技術公司合作，運用西門子自動化和數位化解決方案大幅加速了疫苗生產，以科技夥伴的角色為全球抗疫做出具體貢獻。
BioNTech總部設在德國美因茲(Mainz)，西門子以空前的速度將其位於馬爾堡的既有工廠轉換成生產Covid-19疫苗的設施。該生產工廠自二月份以來持續在生產活性物質以及自三月底開始生產BNT162b2疫苗(COMIRNATY)。BioNTech於2020年秋季即為此購買了具生產生物技術物質能力的生產設施，而西門子與在馬爾堡的現場專家團隊合作，將現有生產mRNA疫苗的設施轉換成生產Covid-19疫苗，轉換建置原本需時一年但大幅縮短到五個月即完成，其中導入關鍵的製造執行系統(Manufacturing Execution System; MES)讓整個專案時程減少了兩個半月的時間。
所有製程皆使用西門子自動化產品SimaticPCS7作業控制系統進行修改以實現自動化：Opcenter製藥執行系統(Opcenter Execution Pharma MES)用於協調子系統和流程控管並分析其品質。mRNA流程包括許多手動工作步驟，例如稱重工作，而透過西門子自動化稱重系統可以執行這些步驟，因為精確測量重量對產品品質至關重要。
